1/ Génomique fonctionnelle des insectes
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1/ Génomique fonctionnelle des insectes

1/ Génomique fonctionnelle des insectes

Le laboratoire DGIMI a une expertise historique en génomique des insectes d'intérêt agro-économique. DGIMI a produit, avec l'appui de la plate-forme INRAE BIPAA à Rennes (https://bipaa.genouest.org/is/), le premier génome assemblé de la légionnaire d'automne, Spodoptera frugiperda (Gouin et al. 2017) ainsi que de la guêpe parasitoïde Hyposoter didymator (Legeai et al. 2020).

Ces ressources génomiques - sans cesse améliorées par l'apport des technologies de séquençage, de logiciels de bioinformatique et la génération de données transcriptomiques, épigénomiques et populationnelles - ont permis de développer des projets visant à comprendre les mécanismes génétiques expliquant les facteurs d'adaptation des insectes à leur environnement. Par ailleurs, l'exploration des génomes d'organismes non-modèles a permis la découverte de mécanismes génétiques uniques comme le fonctionnement des chromosomes holocentriques chez les lépidoptères ou la domestication de séquences virales endogènes chez les guêpes parasitoïdes.

Quelques Projets 

  • SPE HOLO-CEN (PI E. d’Alençon), 
  • SPE CENTROVIR (PI I. Darboux)

 

  • Two genomes of highly polyphagous lepidopteran pests (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) with different host-plant ranges. Gouin A, Bretaudeau A, Nam K, Gimenez S, Aury JM, Duvic B, Hilliou F, Durand N, Montagné N, Darboux I, Kuwar S, Chertemps T, Siaussat D, Bretschneider A, Moné Y, Ahn SJ, Hänniger S, Grenet AG, Neunemann D, Maumus F, Luyten I, Labadie K, Xu W, Koutroumpa F, Escoubas JM, Llopis A, Maïbèche-Coisne M, Salasc F, Tomar A, Anderson AR, Khan SA, Dumas P, Orsucci M, Guy J, Belser C, Alberti A, Noel B, Couloux A, Mercier J, Nidelet S, Dubois E, Liu NY, Boulogne I, Mirabeau O, Le Goff G, Gordon K, Oakeshott J, Consoli FL, Volkoff AN, Fescemyer HW, Marden JH, Luthe DS, Herrero S, Heckel DG, Wincker P, Kergoat GJ, Amselem J, Quesneville H, Groot AT, Jacquin-Joly E, Nègre N, Lemaitre C, Legeai F, d'Alençon E, Fournier P. Sci Rep. 2017 Sep 25;7(1):11816. doi: 10.1038/s41598-017-10461-4.
 

ANR EndoVIRE 2021-2025 (Resp. Anne-Nathalie Volkoff)

 

  • The dual life of ichnoviruses. Darboux I, Cusson M, Volkoff AN. Curr Opin Insect Sci. 2019 Apr;32:47-53. doi: 10.1016/j.cois.2018.10.007. Epub 2018 Oct 25.

Date de modification : 09 décembre 2024 | Date de création : 09 décembre 2024 | Rédaction : N. Nègre , I. Seninet