Enseignement et formations

Les EC et les chercheurs interviennent et ont des responsabilités dans une 50aine d'Unités d’enseignement (UE) de Licence et de Master

• 2 EC (A. CARRE-MLOUKA, A-S. GOSSELIN-GRENET) et 1 chercheur (A. GIVAUDAN) de l'unité sont directement impliqués dans la direction, conception, coordination et évolution du parcours de Master « Interactions Microorganismes-Hôtes-Environnements (IMHE) » de la mention  « Biologie Agrosciences » de l'UM. Ce parcours de Master est particulièrement original et unique dans l’offre régionale en proposant aux étudiants une double formation à la fois théorique et par la recherche en microbiologie, dans tous les aspects de l’écologie et des interactions adaptatives entre les microorganismes et leurs environnements naturels ou anthropisés. https://bioagro.edu.umontpellier.fr/master-biologie-agrosciences/interactions-microorg-hotes

• 1 EC (A.-S. GOSSELIN-GRENET) est co-responsable du parcours de Master « Plant and Microbiological Sciences for Agro-environment (PMSAE) » du nouveau programme international IDIL (Inter-Disciplinary & In-Lab graduate program) de l'Université mis en place à la rentrée universitaire 2022-2023. 
  https://idil.edu.umontpellier.fr
  https://bioagro.edu.umontpellier.fr/plants-microbes-programme-idil
   
• 1 EC (O. THALER) est impliqué dans la direction et la coordination du Parcours Professionnel « Ingénierie en écologie et en gestion de la biodiversité (IEGB) » du Master "Biologie-Écologie-Évolution" de l'UM http://www.masters-biologie-ecologie.com/IEGB
   
• 1 EC (N. NEGRE) est co-responsable du parcours de Master « EpiGenBio » du la mention « Biologie-Santé » (https://masterbs.edu.umontpellier.fr/les-parcours/genetique-epigenetique-controle-du-determinisme-cellulaire/). Ce parcours « Recherche » dispense une formation fondamentale en génétique, épigénétique, génomique et biologie cellulaire.

^{Dans cet espace d’apprentissage modulable, composé d’une salle de travaux pratiques et d’une salle projet informatisée, les étudiants issus de parcours différents travaillent collectivement sur des projets de recherche. Ils se forment aux techniques de séquençage de pointe et valorisent leurs compétences et leurs travaux (publication, poster en congrès), pour une meilleure employabilité.}

Quelques exemples de publications en relation avec le projet BILL

• Anna-Sophie Fiston-Lavier, Anne-Sophie Gosselin-Grenet, Jean-Christophe Avarre. Le projet d'innovation pédagogique BILL. Montpellier Omics Days, Feb 2023, Montpellier, France. ⟨hal-04950566⟩
• Anne-Sophie Gosselin-Grenet, Jean-Christophe Avarre, Etudiants Master IMHE. Le saut d’espèce : quand un virus animal engendre l’émergence d’une maladie humaine. 2020. ⟨hal-04950416⟩
• Sandro Klafack, Anna-Sophie Fiston-Lavier, Sven Bergmann, Saliha Hammoumi, Lars Schröder, et al. Cyprinid herpesvirus 3 Evolves In Vitro through an Assemblage of Haplotypes that Alternatively become Dominant or Under-Represented. Viruses, 2019, 11 (8), 12 p. ⟨10.3390/v11080754⟩ . ⟨hal-02319378⟩
• Barbier M, Jeanjean J, Labadie-Lafforgue E, Loechleiter A, Plumet L, Schatt F, Abdelli Z, Alary S, Benzouaoui H, Casi D, Cornelie S, Monie-Ibanes M, Pierre M, Pirou L, Reggiardo B, Surage I, Teyssier C, Carré-Mlouka A, 2022. Apprentissage par la recherche à l’Université de Montpellier: Etude de la biodiversité microbienne du sol de la réserve naturelle du Lunaret. Numéro spécial d’Etude et Gestion des Sols « Biodiversité des sols ».
• Chapitre The Microbial Ecology of Milk Kefir and Koumiss dans l’ouvrage Fermented Milk and Dairy Products : Global Perspectives (publication prévue en 2025) Chabert M, Deflandre C, El-Jabli A, Féliu G, Forniès L, Manfé T, Mercey A, Poivet C, Ressad H, Santer C,  Tichit A, Bellet V, Paramithiotis S, Carré-Mlouka A, Teyssier C
   

• Posters présentés par les étudiants du master au congrès de la Société Française de Microbiologie (SFM)  en octobre 2022 :
  • Recherche de cyanobactéries toxiques dans le Lez, Sylvia Abdelmalek, Oussama Assaoui, Julie Balland, Ninon Besson, Inès Boussière, Emilie Brivet, Oceane Carpentier, Adeline Dehail, Laura Di Pietro, Fiona Elmaleh, Charly Engerbeau, Magali Hiaumet, Nais Lobo, Pierre-Michel Marty, Yanis Meyer, Celia Pasternicki, Arthur Planche, Benjamin Prat, Lucie Sanchez, Justine Thorel, Victoria Mariotti, Etudiants du Master 2 IMHE promotion 2022-2023, Rutger De Wit, Annick Méjean, Corinne Teyssier, Alyssa Carré-Mlouka (auteur correspondant)
  • ​​Biodiversité microbienne et potentiel antimicrobien du kéfir de fruits, une boisson fermentée artisanale, Marine Belamy, les étudiants du Master 1 IMHE, Donika Krasteva, Luis Portillo Lemus, Fréderic Boudard, Alyssa Carré-Mlouka,  Françoise Fons, Vincent Chochois, Virginie Bellet, Corinne Teyssier 

Les enseignants-chercheurs de DGIMI interviennent et supervisent un grand nombre d’enseignements de Licence et Master à la Faculté des Sciences de l'Université de Montpellier correspondant à leurs domaines d’expertise

Alyssa CARRE-MLOUKA : Microbiologie 2 (L2 SV), Microbiologie 3 (L3 SV), Approche pratique de la biodiversité bactérienne (L3 SV) ; Spécialisation II en Biologie-Mécanismes du Vivant-APP (L3-SV-APP) Ecologie microbienne, Microbiologie et toxicologie alimentaires et environnementales (M1 IMHE), Ecologie microbienne moléculaire  (M1 IMHE), Microbial ecology (M1 IDIL PMSAE), Interactions symbiotiques et parasitaires (M1 IMHE et M1 BE B2I), Ingénierie des bioprocédés - Métabolisme et bioproduction  (M1 IMHE et M2 BS IBIS), Analyse critique et synthèse d'articles scientifiques (M2 IMHE), Bioproduction et valorisation de la biodiversité microbienne  (M2 IMHE et M2 BS IBIS), Rôle des microorganismes dans fonctionnement écosystèmes (M2 IMHE et M2 IDIL PMSAE)., Sciences biologiques Fondamentales 1 (M1 MEEF BGB), Enseigner les Sciences de la Vie 2 (M1 MEEF SVT), Eau et infections bactériennes et virales (M2 Master Contaminants Eau Santé), Genetics and Molecular Determinism (M1 DYNAMEID)

Anne-Sophie GOSSELIN-GRENET : Des molécules aux cellules (L1 SVSE), Biochimie et biologie moléculaire (L1 SVSE), Microorganismes (L3 BE), Adaptations parasitaires (L3 BE), Virologie (L1, L2, L3 SV), Ecologie virale (M1 IMHE et IDIL PMSAE), Emergences Résistances Adaptations (M1 IMHE), Immunité et génétique des interactions microorganismes-hôtes (M1 IMHE), Bases moléculaires des maladies infectieuses (M1 Infection biology), Microbiologie de l’eau (M1 IMHE), Ecologie microbienne moléculaire (M1 IMHE), projet BILL (M1 IMHE et M1 Bioinformatique), Interactions symbiotiques et parasitaires (M1 IMHE et M1 BE B2I), Interactions microorganismes-Hôtes (M2 IMHE et M2 B2I), Virologie (M2), Bioproduction et valorisation de la diversité microbienne (M1 IMHE et M1 BS IBIS), Bioénergies (M1 IMHE et M1 Energie), et les enseignements de virologie dans les cursus de préparation aux concours de l’enseignement CAPES, CAPET et Agreg (L3 CME SVT, M2 MEEF SVT, M1 et M2 MEEF Biotechnologies).

Nicolas NEGRE : Génétique 1 (L2), Génétique fonctionnelle (L3), Génétique et épigénétique (L3), Génétique du développement (M1 EpiGenBio), Epigénétique et évolution des espèces vivantes (M1 EpiGenBio), Eléments de base de la biologie (M1 Bioinformatique), Analyses de données en bioinformatique (M1 Bioinformatique), Bases moléculaires de l'expression génique (M1 Bioinformatique).

Olivier THALER : Socio-économie et droit de l'environnement, Agroécologie, Outils de la concertation territoriale, Salon de l'écologie-2, Impact écologique des sources et usages de l'énergie, Socio-économie et droit de l'Energie, Projet Apprentissage M2-GE, STAGE de fin d'études M2 GE Double Compétence par APPRENTISSAGE, Stage de fin d'études M2 GE Biodiv'In

Les personnels non enseignants de DGIMI interviennent aussi régulièrement dans les formations universitaires

Bernard DUVIC : Immunité des insectes (M1 IMHE), Immunité humorale des insectes et immunodépression induite par les bactéries entomopathogènes (M2 IMHE)

Julien BRILLARD : Epigénétique bactérienne (M1 Biologie-Santé - EpiGenBio)

Julien BRILLARD et Jean-Claude OGIER : In-Lab « characterization of entomopathogenic-associated microbiota » dans le master PMSAE du programme IDIL 

Sophie GAUDRIAULT : microbiotes, métagenomique, pathobiome et holobionte (M2 IMHE)

Alain GIVAUDAN : Les bactéries entomopathogènes et leurs interactions. (M2 IMHE) ; mobilité bactérienne et virulence (M2 BS Infection Biology)

Anne-Nathalie VOLKOFF : Les virus endogènes de guêpes parasitoïdes: un exemple de « domestication » de virus (M2 IMHE & B2I)